In het bestuur van de Stichting Kenniscentrum Phrenos zitten vertegenwoordigers uit cliëntenbeweging, zorginstellingen, wetenschap, zorgverzekeraars, maatschappelijke partijen en politiek.
Lidmaatschap van het bestuur is een onbezoldigde functie. Bij uitzondering kunnen bestuursleden gebruikmaken van een vacatieregeling. Het huidige bestuur ziet er als volgt uit:

• Annemarie Stokman, lid – manager zorg, Gemeente Amsterdam
• Jan-Willem Bedeaux, penningmeester – bestuurder van RIBW Overijssel Maatschappelijke GGZ
• Lara de Brito, voorzitter – journalist, voormalig wethouder gemeente Wageningen
• Marie-Claire Maillé, lid – medisch adviseur ggz, CZ
• Philippe Delespaul, lid – hoogleraar innovatie in de ggz bij Universiteit Maastricht en gz-psycholoog bij Mondriaan Maastricht/Heerlen