In het bestuur van de Stichting Kenniscentrum Phrenos zitten vertegenwoordigers uit cliëntenbeweging, zorginstellingen, wetenschap, zorgverzekeraars, maatschappelijke partijen en politiek.
Lidmaatschap van het bestuur is een onbezoldigde functie. Bij uitzondering kunnen bestuursleden gebruikmaken van een vacatieregeling. Het huidige bestuur ziet er als volgt uit:

• Marie-Claire Maille, voorzitter – manager behandelzaken, GGzE
• Jan-Willem Bedeaux, penningmeester – bestuurder van GGZ Oost Brabant
• Philippe Delespaul, lid – hoogleraar innovatie in de ggz bij Universiteit Maastricht en gz-psycholoog bij Mondriaan Maastricht/Heerlen
• Evelien Hulshof, lid – ervaringsdeskundige
• Dide Hoop, lid – ervaringsdeskundige bij Reinier van Arkel